第１期から存在する魔法カード《融合》を軸に戦うデッキ。
《融合》は非常に手札消費が多い魔法カードなので、それをいかに解消するかがこのデッキの肝である。
後にＥ・ＨＥＲＯ等の融合召喚を軸としたカテゴリや、《未来融合−フューチャー・フュージョン》等の類似効果を持つカードが登場したため、デッキの派生も多様に存在する。
《融合/Polymerization》 通常魔法 手札・自分フィールド上から、融合モンスターカードによって決められた 融合素材モンスターを墓地へ送り、その融合モンスター１体を エクストラデッキから特殊召喚する。
まずは《融合》を手札に加える事を優先する。
そして、それを利用して融合召喚を行うため、融合モンスターと融合素材を吟味する。
融合素材には、融合素材代用モンスターを使う事も考えられる。
むしろ融合モンスターに幅を出すためにも、融合素材代用モンスターの使用は必須となるだろう。
直接的なサポートカードの他、融合召喚は手札消費が激しいため、それを補うものを採用したい。
《融合》はサポートカードが豊富なものの、手札消費が激しい弱点を持つ。
そこで現在多く存在する《融合》以外の融合召喚を行えるカードを考える。
時には共存させ、時にはどちらかのみを採用し、プレイスタイルや環境に合ったデッキ構築を目指したい。
《沼地の魔神王》と《沼地の魔獣王》が《サルベージ》で回収できることに目をつけたデッキ。
《Ｅ・ＨＥＲＯ バブルマン》や《ヒューマノイド・スライム》、《ひょうすべ》等の融合素材を採用すれば、ますます《サルベージ》が活躍する。
《Ｅ・ＨＥＲＯ フォレストマン》や《融合呪印生物−地》が地属性である事に目を付けたデッキ。
両者とも《巨大ネズミ》からリクルートできるのにも注目したい。
融合召喚を得意とするＥ・ＨＥＲＯを軸としたデッキ。
詳しくは当該ページを参照。
《サイバー・ドラゴン》系統の融合モンスターを扱うデッキ。
《パワー・ボンド》や《未来融合−フューチャー・フュージョン》を使っての、１ターンキルを得意とする。
詳しくは当該ページを参照。
召喚条件は厳しいが、圧倒的なステータスを持つ《レインボー・ネオス》の融合召喚をメインとするデッキ。
詳しくは当該ページを参照。
場持ちが良く、サポートカードも豊富な《Ｄｒａｇｏｏｎ Ｄ−ＥＮＤ》の融合召喚をメインとするデッキ。
詳しくは当該ページを参照。
多様な効果を持つ《超魔導剣士−ブラック・パラディン》の融合召喚をメインとするデッキ。
詳しくは当該ページを参照。
通常モンスターを融合素材とし、そのサポートカードの《凡骨の意地》で手札消費を補う。
詳しくは当該ページを参照。
《心眼の女神》が光属性・天使族、《破壊神 ヴァサーゴ》が闇属性・悪魔族であることに目をつけ、天魔神を織り交ぜたデッキ。
自身が光属性・天使族であり、融合素材がそれぞれ光属性・天使族と闇属性・悪魔族である《聖女ジャンヌ》が相性がよい。
マスタールール以降、エクストラデッキの枚数に制限ができた。
そのため、【Ｅ・ＨＥＲＯ】 等融合モンスターの種類や枚数が元々多いデッキはかなりの影響を受けている。