魔法・罠・効果モンスターの効果など、カードに記された特殊能力全般を指します。
コストを払う行為や、戦闘によるモンスターの破壊などはこれに当てはまりません。
基本ルールとカードの効果が矛盾している場合、基本的に各カードの効果が優先されます。
例えば基本ルールではモンスターは１ターンに１回しか攻撃できませんが、カードの効果によって２回攻撃できるようにすることも可能です。
（公式ルールブック マスタールール２対応 バージョン 1.1 より引用）
―効果を複製するカード
―効果を変更するカード