効果モンスター・魔法・罠カードに記されているそのカードの使用法を指します。
最新のカードテキストでは、「(1)：〜〜。」「(2)：〜〜。」というように記載されており、１つ１つのカードの効果が分かりやすいようになっています。
一部のカードには、その効果を発動するための条件となる手順やコスト（手札を捨てる、ライフポイントを払う、など）が定められているカードも存在します。
効果を発動するためにモンスターをリリースする行為や、戦闘によるモンスターの破壊などは「カードの効果」には当てはまりません。
基本ルールとカードの効果が矛盾している場合、基本的に各カードの効果が優先されます。
例えば基本ルールではモンスターは１ターンに１回しか攻撃できませんが、カードの効果によって２回攻撃できるようにすることも可能です。
（公式ルールブック マスタールール３対応 バージョン 1.0 より引用）
―効果を複製するカード
―効果を変更するカード
―特別な「効果を得る」カード
（以下のカードの「効果を得る」テキストは、《スキルドレイン》などで無効にはならないが、《Ｎｏ.８ 紋章王ゲノム・ヘリター》などで複製可能であり、永続効果・ルール効果・効果外テキストとも異なるためここに記す）
―特別な「別の名前として扱う」カード
（以下のカードの「○○として(も)扱う」テキストは、《スキルドレイン》などで無効にはならないが、《Ｎ・ブラック・パンサー》などで複製可能であり、永続効果・ルール効果・効果外テキストとも異なるためここに記す）