コンボなどにおけるカードの効果の相性のこと。
英語の「synergy(相乗作用/共同作用)」に由来する。
コンボがカード同士の組み合わせを指すのに対し、シナジーはそれぞれの効果が相互に噛み合うことを指す。
例えば《団結の力》を《アレキサンドライドラゴン》に装備した場合はただ強化されるだけだが、《マハー・ヴァイロ》に装備した場合はモンスター効果により更に強化される。
このようなお互いの効果によって大きな結果を生み出せる組み合わせは、「シナジーがある・強い・高い」と言われる。
特に最近のカテゴリデッキの中には、あらかじめ組み合わせて使うことを想定されたような非常にシナジーの強いカード群が多い。