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第2期から第5期までの期間使用されていたルール。
現在使用されているOCGのルールのほとんどは、この時期までに成立している。
(Booster R1付属ルールカードより引用)
現行のプレイヤーには馴染みが薄いであろうルールのほとんどが廃止され、現在知られている遊戯王OCGのほとんどがこのルールによって成立している。
禁止・制限カードの制度が取り入れられたのも、この頃である。
この他、第2期冒頭にチェーンとスペルスピードのシステムが導入され、ゲームとしての体裁が整えられた。
一方で《暗黒魔族ギルファー・デーモン》の登場で急遽タイミングを逃すというルールが制定されたり、《ならず者傭兵部隊》と《落とし穴》の関係から優先権の扱いが問題になったりもしている。
2008年3月15日、マスタールールへの移行によりその役割を終えた。
アニメでは原作のデュエルを中途半端にアレンジしたものが多いためか、原作のルールと混同した描写や発言が時折見受けられる。
(《天使のサイコロ》等)