融合モンスターだけを入れることができるデッキ。（詳しくは融合デッキゾーン参照）
総枚数に上限が無く、普通のデッキの様な「枚数が多い事によるデメリット」が存在し無かった為、融合モンスターを有るだけ叩き込んだ、膨大な枚数の融合デッキを所有しているデュエリストも少なくなかった。
しかしSHADOW OF INFINITYで《記憶破壊者》というある意味革命的なモンスターが登場した事により、かつての様な無茶な融合デッキを所有しているデュエリストは今では殆ど見られなくなってしまった。
元々「お遊び」に近いものだったので戦力的な被害は無いと思われるが、少し寂しい様な気もする今日この頃である。